冷凍干燥機在低溫下干燥時，物質中的一些揮發性成分損失很小。凍干過程中，微生物的生長和酶的作用無法進行，因此能保持原來的形狀。由于在凍結的狀態下進行干燥，因此體積幾乎不變，保持了原來的結構，不會發生濃縮現象。由于物料中水分在預凍以后以冰晶的形態存在，原來溶于水中的無機鹽類溶解物質被均勻地分配在物料之中。升華時，溶于水中的溶解物質就析出，避免了一般干燥方法中因物料內部水分向表面遷移所攜帶的無機鹽在表面析出而造成表面硬化的現象。干燥后的物質疏松多孔，呈海綿狀，加水后溶解迅速而*，幾乎立即恢復原來的形狀。由于干燥在真空下進行，氧氣極少，因此一些易氧化的物質得到了保護。干燥能排除95％-99%以上的水分，使干燥后產品能長期保存而不致變質。

　　在凍干之前，把需要凍干的產品分裝在合適的容器內，一般是玻瓶或安瓶，裝量要均勻，蒸發表面盡量大而厚度盡量薄些；然后放入與凍干箱尺寸相適應的金屬盤內。裝箱之前，先將凍干箱進行空箱降溫，然后將產品放入凍干箱內進行預凍，抽真空之前要根據冷凝器冷凍機的降溫速度提前使冷凝器工作，抽真空時冷凝器應達到-40℃左右的溫度，待真空度達到一定數值后，即可對箱內產品進行加熱。一般加熱分兩步進行：加溫不使產品的溫度超過共熔點的溫度；待產品內水份基本干完后進行第二步加溫，這時可迅速地使產品上升的規定的高溫度。在高溫度保持數小時后，即可結束凍干。整個升華干燥的時間約12-24小時左右，與產品在每瓶內的裝量、總裝量、玻璃容器的形狀規格、產品的種類、凍干曲線及機器的性能等等有關。

　　凍干結束后，要放干燥無菌的空氣進入干燥箱，然后盡快地進行加塞封口，以防重新吸收空氣中的水份。

　　冷凍干燥機凍干過程中把產品和板層的溫度、冷凝器溫度和真空度對照時間劃成曲線，叫做凍干曲線。一般以溫度為縱坐標，時間為橫坐標。凍干不同的產品采用不同的凍干曲線。同一產品使用不同的凍干曲線時，產品的質量也不相同，凍干曲線還與冷凍干燥機的性能有關。因此不同的產品，不同的凍干設備應用不同的凍干曲線。